【2026年最新】農業保険の確定申告・経費計上の方法を徹底解説

2026年5月2日

「収入保険や農業共済の掛金は経費になるの？補填金を受け取ったら確定申告でどう処理すればいい？」

農業の仕事をしながら、領収書の整理や帳簿づけ、さらに「掛金や補填金を経費にできるの？」という判断まで自分でこなすのは、農家さんにとってとても大変なことです。

「掛金って経費になるの？」「補填金はどう申告すればいいの？」「農業経営基盤強化準備金制度って何に使えるの？」——こういった疑問を自分だけで解決しようとすると、調べるだけでも時間がどんどんなくなってしまいます。

この記事では、農業保険の確定申告と経費計上のやり方をわかりやすく説明していきます。

この記事でわかること

– 農業保険の掛金の確定申告での取り扱い（必要経費の計上方法）
– 収入保険・農業共済の補填金・共済金の申告方法
– 農業経営基盤強化準備金制度の活用方法
– 青色申告での帳簿記入の実践的なポイント

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この記事を書いた人

太智昭栄

Shoei Tachi

農業保険の掛金の確定申告：必要経費として計上する

農業保険の掛金（保険料・共済掛金）は、農業所得の計算において必要経費として計上できます。これにより農業所得が減少し、所得税・住民税の節税効果があります。

農業保険の掛金を必要経費として計上するには、青色申告の帳簿に正確に記録することが必要です。仕訳の例は以下のとおりです。

取引内容	借方	貸方
農作物共済の掛金30,000円を現金で支払い	保険料30,000円	現金 30,000円
収入保険の保険料50,000円を口座振替	保険料 50,000円	普通預金 50,000円

TACHIFARM代表

勘定科目は「保険料」として記入します。

クラウド会計を使用している場合は、支払い記録を入力するだけで自動的に勘定科目が割り当てられ、確定申告書に反映されます。

農業保険から補填金・共済金を受け取った場合、その金額は農業収入として申告する必要があります。

施設（ハウス）や農機具が損壊して共済金を受け取った場合、共済金は一旦「雑収入（共済金収入）」として計上し、修繕費や取得費を別仕訳で処理するのが実務・税務上の正しい方法です。

共済金と修繕費は相殺せず、それぞれ別々に記帳します。

タイミング	借方	貸方
共済金を受け取ったとき	現金預金 800,000円	雑収入（共済金）800,000円
修繕費を支払ったとき	修繕費 600,000円	現金預金 600,000円

共済金が修繕費を上回った差額（この例では20万円）は、課税対象の収入となります。なお、共済金と修繕費を相殺して純額のみ記帳する方法は、税務調査で取引の実態が見えにくくなるため推奨されません。

旧機械の除却・新品の取得・共済金の受領を、それぞれ独立した仕訳で処理します。

旧機械の除却損は損金、新品農機具は資産として計上し減価償却で処理します。共済金はあくまで収入として別に計上します。

TACHIFARM代表

この処理は複雑なため、税理士に相談することをおすすめします。

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農業経営基盤強化準備金制度は、対象農業者が経営所得安定対策等の交付金を財源として準備金を積み立てた場合に、その金額を農業所得から損金算入（控除）できる制度です。収入保険の積立方式とは全く別の制度です。

項目	内容
積立上限	経営所得安定対策等の交付金の交付額の範囲内（かつ農業所得を超えない額）
控除対象	積立額をその年の農業所得から控除
活用目的	農業機械の購入・施設の整備等
対象者	認定農業者・認定新規就農者（地域計画等に位置付けられた者）